第 2 條
- 1本法適用於行政院及其所屬各級機關（以下簡稱機關）。但國防組織、外交駐外機構、警察機關組織、檢察機關、調查機關及海岸巡防機關組織法律另有規定者，從其規定。
- 2行政院為一級機關，其所屬各級機關依層級為二級機關、三級機關、四級機關。但得依業務繁簡、組織規模定其層級，明定隸屬指揮監督關係，不必逐級設立。
第 3 條
本法用詞定義如下：
- 一、機關：就法定事務，有決定並表示國家意思於外部，而依組織法律或命令（以下簡稱組織法規）設立，行使公權力之組織。
- 二、獨立機關：指依據法律獨立行使職權，自主運作，除法律另有規定外，不受其他機關指揮監督之合議制機關。
- 三、機構：機關依組織法規將其部分權限及職掌劃出，以達成其設立目的之組織。
- 四、單位：基於組織之業務分工，於機關內部設立之組織。
第 5 條
- 1機關組織以法律定之者，其組織法律定名為法。但業務相同而轄區不同或權限相同而管轄事務不同之機關，其共同適用之組織法律定名為通則。
- 2機關組織以命令定之者，其組織命令定名為規程。但業務相同而轄區不同或權限相同而管轄事務不同之機關，其共同適用之組織命令定名為準則。
- 3本法施行後，除本法及各機關組織法規外，不得以作用法或其他法規規定機關之組織。
第 6 條
- 1行政機關名稱定名如下：
- 一、院：一級機關用之。
- 二、部：二級機關用之。
- 三、委員會：二級機關或獨立機關用之。
- 四、署、局：三級機關用之。
- 五、分署、分局：四級機關用之。
- 2機關因性質特殊，得另定名稱。
第 7 條
機關組織法規，其內容應包括下列事項：
- 一、機關名稱。
- 二、機關設立依據或目的。
- 三、機關隸屬關係。
- 四、機關權限及職掌。
- 五、機關首長、副首長之職稱、官職等及員額。
- 六、機關置政務職務者，其職稱、官職等及員額。
- 七、機關置幕僚長者，其職稱、官職等。
- 八、機關依職掌設有次級機關者，其名稱。
- 九、機關有存續期限者，其期限。
- 十、屬獨立機關者，其合議之議決範圍、議事程序及決議方法。
第 8 條
- 1機關組織以法律制定者，其內部單位之分工職掌，以處務規程定之；機關組織以命令定之者，其內部單位之分工職掌，以辦事細則定之。
- 2各機關為分層負責，逐級授權，得就授權範圍訂定分層負責明細表。
第 10 條
機關及其內部單位具有下列各款情形之一者，應予調整或裁撤：
- 一、階段性任務已完成或政策已改變者。
- 二、業務或功能明顯萎縮或重疊者。
- 三、管轄區域調整裁併者。
- 四、職掌應以委託或委任方式辦理較符經濟效益者。
- 五、經專案評估績效不佳應予裁併者。
- 六、業務調整或移撥至其他機關或單位者。
第 11 條
- 1機關組織依本法規定以法律定之者，其設立依下列程序辦理：
- 一、一級機關：逕行提案送請立法院審議。
- 二、二級機關、三級機關、獨立機關：由其上級機關或上級指定之機關擬案，報請一級機關轉請立法院審議。
- 2機關之調整或裁撤由本機關或上級機關擬案，循前項程序辦理。
第 12 條
機關組織依本法規定以命令定之者，其設立、調整及裁撤依下列程序辦理：
- 一、機關之設立或裁撤：由上級機關或上級機關指定之機關擬案，報請一級機關核定。
- 二、機關之調整：由本機關擬案，報請上級機關核轉一級機關核定。
第 18 條
- 1首長制機關之首長稱長或主任委員，合議制機關之首長稱主任委員。但機關性質特殊者，其首長職稱得另定之。
- 2一級、二級機關首長列政務職務；三級機關首長除性質特殊且法律有規定得列政務職務外，其餘應為常務職務；四級機關首長列常務職務。
- 3機關首長除因性質特殊法規另有規定者外，應為專任。
第 20 條
- 1一級機關置幕僚長，稱秘書長，列政務職務；二級以下機關得視需要，置主任秘書或秘書，綜合處理幕僚事務。
- 2一級機關得視需要置副幕僚長一人至三人，稱副秘書長；其中一人或二人得列政務職務，至少一人應列常任職務。
第 21 條
- 1獨立機關合議制之成員，均應明定其任職期限、任命程序、停職、免職之規定及程序。但相當二級機關之獨立機關，其合議制成員中屬專任者，應先經立法院同意後任命之；其他獨立機關合議制成員由一級機關首長任命之。
- 2一級機關首長為前項任命時，應指定成員中之一人為首長，一人為副首長。
- 3第一項合議制之成員，除有特殊需要外，其人數以五人至十一人為原則，具有同一黨籍者不得超過一定比例。
第 25 條
- 1機關之內部單位層級分為一級、二級，得定名如下：
- 一、一級內部單位：
- （一）處：一級機關、相當二級機關之獨立機關及二級機關委員會之業務單位用之。
- （二）司：二級機關部之業務單位用之。
- （三）組：三級機關業務單位用之。
- （四）科：四級機關業務單位用之。
- （五）處、室：各級機關輔助單位用之。
- 二、二級內部單位：科。
- 一、一級內部單位：
- 2機關內部單位層級之設立，得因機關性質及業務需求彈性調整，不必逐級設立。但四級機關內部單位之設立，除機關業務繁重、組織規模龐大者，得於科下分股辦事外，以設立一級為限。
- 3機關內部單位因性質特殊者，得另定名稱。
第 26 條
- 1輔助單位依機關組織規模、性質及層級設立，必要時其業務得合併於同一單位辦理。
- 2輔助單位工作與本機關職掌相同或兼具業務單位性質，報經該管一級機關核定者，不受前項規定限制，或得視同業務單位。
第 29 條
- 1行政院依下列各款劃分各部主管事務：
- 一、以中央行政機關應負責之主要功能為主軸，由各部分別擔任綜合性、統合性之政策業務。
- 二、基本政策或功能相近之業務，應集中由同一部擔任；相對立或制衡之業務，則應由不同部擔任。
- 三、各部之政策功能及權限，應儘量維持平衡。
- 2部之總數以十四個為限。
第 32 條
- 1相當二級機關之獨立機關組織規模建制標準如下：
- 一、業務單位以四處至六處為原則。
- 二、各處以三科至六科為原則。
- 2前項獨立機關總數以三個為限。
- 3第一項以外之獨立機關，其內部單位之設立，依機關掌理事務之繁簡定之。
第 33 條
- 1二級機關為處理技術性或專門性業務需要得設附屬之機關署、局。
- 2署、局之組織規模建制標準如下：
- 一、業務單位以四組至六組為原則。
- 二、各組以三科至六科為原則。
- 3相當二級機關之獨立機關為處理第一項業務需要得設附屬之機關，其組織規模建制標準準用前項規定。
- 4第一項及第三項署、局之總數除地方分支機關外，以七十個為限。
第 35 條
- 1行政院應於本法公布後三個月內，檢討調整行政院組織法及行政院功能業務與組織調整暫行條例，函送立法院審議。
- 2本法公布後，其他各機關之組織法律或其他相關法律，與本法規定不符者，由行政院限期修正，並於行政院組織法修正公布後一年內函送立法院審議。