第 2 條
- 1中華民國之專屬經濟海域為鄰接領海外側至距離領海基線二百浬間之海域。
- 2前項專屬經濟海域包括水體、海床及底土。
- 3中華民國之大陸礁層為其領海以外，依其陸地領土自然延伸至大陸邊外緣之海底區域。
- 4前項海底區域包括海床及底土。
第 4 條
- 1中華民國之專屬經濟海域或大陸礁層，與相鄰或相向國家間之專屬經濟海域或大陸礁層重疊時，其分界線依衡平原則，以協議方式劃定之。
- 2前項協議未能達成前，得與相鄰或相向國家基於諒解及合作之精神，作成過渡時期之臨時安排。
- 3前項臨時安排不妨礙最後分界線之劃定。
第 5 條
中華民國在其專屬經濟海域或大陸礁層享有並得行使下列權利︰ 一、探勘、開發、養護、管理海床上覆水域、海床及其底土之生物或非生物資源之主權權利。 二、人工島嶼、設施或結構之建造、使用、改變或拆除之管轄權。 三、海洋科學研究之管轄權。 四、海洋環境保護之管轄權。 五、其他依國際法得合理行使之權利。 中華民國在其專屬經濟海域享有並得行使利用海水、海流、風力所產生之能源或其他活動之主權權利。 中華民國在其大陸礁層享有並得行使舖設、維護或變更海底電纜或管線之管轄權。
第 8 條
- 1在中華民國專屬經濟海域或大陸礁層從事人工島嶼、設施或結構之建造、使用、改變或拆除，應經中華民國政府許可；其許可辦法，由行政院定之。
- 2中華民國法令適用於前項人工島嶼、設施或結構。
- 3第一項人工島嶼、設施或結構之四周，應劃定安全區，採取適當措施，以確保航行安全及人工島嶼、設施或結構之安全。
- 4前項安全區之寬度，應符合一般國際標準或相關國際組織所建議之標準。
第 9 條
- 1在中華民國專屬經濟海域或大陸礁層從事海洋科學研究，應經中華民國政府許可，並應接受其管制。中華民國政府於必要時得撤銷許可或暫停或停止其海洋科學研究活動。
- 2在中華民國專屬經濟海域或大陸礁層進行海洋科學研究活動，應遵守下列規定：
- 一、不妨礙中華民國在其專屬經濟海域或大陸礁層行使各項權利。
- 二、確保中華民國政府指派代表參與之權利。
- 三、隨時提供進度報告，並提出初步結論與最後結論。
- 四、隨時提供完整且不損其科學價值之資料複本、數據或樣本及各項評估報告。
- 五、確保研究資料利用過程中不得損害中華民國安全及利益。
- 六、在計畫有重大改變時，立即通知中華民國政府。
- 七、除另有協議外，不得調查海洋資源。
- 八、不得破壞海洋環境。
- 九、除另有協議外，在結束後立即拆遷各項研究設施或裝備。
- 十、其他相關法律及國際協定之規定。
- 3第一項許可辦法，由行政院定之。
第 11 條
- 1在中華民國專屬經濟海域航行之船舶，有任何違法污染海洋環境之排放行為時，中華民國得要求該船提供其識別標誌、登記港口、上次停泊及下次停泊之港口，以及其他必要之相關資料，以確定是否有違法行為發生。
- 2前項有違法排放嫌疑之船舶，若拒絕提供相關規定之資料，或所提供之資料與實際情況顯然不符，或未持有效證件與紀錄，或依實際情況確有進行檢查之必要時，中華民國得對該船進行實際檢查，並在有充分證據時，提起司法程序。
- 3前項被檢查或起訴之船舶，依國際協約規定之程序提供保證書或適當之財物擔保者，應准其繼續航行。
第 13 條
- 1在中華民國專屬經濟海域或大陸礁層之活動，除法律另有規定者外，不得損害天然資源或破壞自然生態。
- 2中華民國專屬經濟海域或大陸礁層天然資源或自然生態，因行為人故意或過失致損害或破壞時，該行為人與其雇用人應負連帶賠償責任。
第 14 條
- 1對洄游於中華民國專屬經濟海域內外之魚種，中華民國政府具有養護及管理之權利。外國漁船在捕撈此類魚種時，應適當顧及中華民國對此類魚種之養護及管理措施。
- 2前項洄游魚種種類及養護管理措施，由行政院訂定公告之。
第 15 條
- 1在中華民國大陸礁層從事海底電纜或管道之舖設、維護或變更，其路線之劃定，應經中華民國政府之許可；其許可辦法，由行政院定之。
- 2中華民國政府為探勘、開發、管理、養護大陸礁層之非生物資源或定居種生物資源，或為防止、減少、管制管道造成之污染，得不為前項之許可。
第 16 條
中華民國之國防、警察或其他機關，對在專屬經濟海域或大陸礁層之人或物，認為有違反中華民國相關法令之虞時，得進行緊追、登臨、檢查；必要時，得強制驅離、或逮捕其人員，或扣留其船舶、航空器、設備、物品等，並提起司法程序。
第 18 條
- 1在中華民國專屬經濟海域或大陸礁層，故意損害天然資源或破壞自然生態者，處五年以下有期徒刑、拘役或科或併科新臺幣五千萬元以下罰金。
- 2未經許可，以船舶或其他機械設備方式，在中華民國專屬經濟海域或大陸礁層採取土石者，處一年以上七年以下有期徒刑，得併科新臺幣一億元以下罰金。
- 3供前項犯罪用之船舶或其他機械設備，經判決沒收確定，得視個案情節需要拍賣或變賣，或專案報准依下列方式之一處置之：
- 一、無償留供公用。
- 二、廢棄。
- 三、為其他適當之處置。
第 19 條
- 1未經許可，在中華民國專屬經濟海域或大陸礁層從事人工島嶼設施或結構之建造、使用、改變或拆除者，處新臺幣一千萬元以上五千萬元以下罰鍰，並得沒入建造之人工島嶼、設施或結構，或令其回復原狀。
- 2經許可後，違反許可內容或目的者，處新臺幣五百萬元以上二千萬元以下罰鍰，並通知限期改善，屆期仍未改善者，撤銷許可並得強制拆除。
第 20 條
未經許可，有下列情形之一者，處新臺幣一百萬元以上五百萬元以下罰鍰，並得沒入船舶、設備及採（捕、撈）獲物︰ 一、在中華民國專屬經濟海域從事生物資源或非生物資源之探勘、開發、管理、養護。 二、在中華民國大陸礁層從事非生物資源或定居種生物資源之探勘、開發、管理、養護。 經許可後，違反許可內容或目的者，處新臺幣二十萬元以上二百萬元以下罰鍰，並得沒入採（捕、撈）獲物。
第 22 條
- 1未經許可，在中華民國專屬經濟海域或大陸礁層從事海洋科學研究者，處新臺幣五十萬元以上二百萬元以下罰鍰，並得沒入相關探測儀器及資料。
- 2經許可後，違反許可之內容、目的或第九條第二項所列各款情形者，亦同。