第 3 條
主任工程司權責如下: 一、綜理處務文稿綜核。 二、主管業務之規劃、推動及執行。 三、綜合文件之督導撰擬。 四、工作分配、領導及監督。 五、主管業務報告之編擬。 六、分層負責範圍內工作權責問題之協調及解決。 七、其他交辦事項。
第 5 條
綜合課掌理事項如下: 一、土地徵收、撥用、登記、土地改良物勘估之配合處理。 二、地上及地下管線物拆遷處理與道路管制、封鎖、改道規劃及協調。 三、技術圖書資料管理。 四、統計、調查業務及交通網路地理資訊系統。 五、人民陳情案件之處理。 六、資訊網路與電腦軟體硬體設備規劃及建置。 七、工程人員技術訓練及資訊教育訓練。 八、技術規範條文解釋、施工技術規範、製圖規範檢討及修訂建議。 九、工程參觀及國際性、國內性工程技術研討會。 十、其他有關綜合業務事項。
第 6 條
工務課掌理事項如下: 一、工務管理事務(含工程開竣工、停復工及展延審核)。 二、施工計畫及進度管理。 三、工程預算彙總控管。 四、一般條款、契約文件解釋。 五、契約變更及變更審核。 六、品質管理(上級機關施工查核、品質稽查計畫擬定及執行)。 七、環境保護及安全衛生管理。 八、爭議調處仲裁訴訟案件處理。 九、工地重大事故處理及善後方案執行。 十、其他有關工務事項。
第 7 條
水環課掌理事項如下: 一、捷運設施建築物、機廠與軌道區等設置之水電工程、消防工程、給水 系統、污水與廢水之排水系統、建築工程電梯及電扶梯之系統、環境 控制系統等施工之現場監督。 二、與其他介面工程介面整合之配合處理。 三、監造顧問執行監造之監督。 四、其他有關水環事項。
第 8 條
軌道課掌理事項如下: 一、軌道工程、駐廠檢測、工程變更處理、廠商協調、施工及技術支援之 現場監督。 二、與其他介面工程介面整合之配合處理。 三、監造顧問執行監造之監督。 四、其他有關軌道事項。
第 9 條
系統機電課掌理事項如下: 一、電聯車、行包處理、機廠維修設備及維修管理系統工程、駐廠檢測、 工程變更處理、廠商協調、施工及技術支援之現場監督。 二、電力、號誌、月台門、通訊、中央監控、自動收費工程、駐廠檢測、 工程變更處理、廠商協調之現場監督。 三、監造顧問執行監造之監督。 四、與其他介面工程介面整合之配合處理。 五、其他有關系統機電事項。
第 10 條
秘書室掌理事項如下: 一、施政方針、施政計畫、工作報告及重要資料之彙編。 二、重要會議、會報之籌備與紀錄、各種會議會場佈置及各項活動之配合 辦理。 三、重要業務與交辦案件之管制、機要事務之辦理及分層負責明細表之研 擬。 四、公共關係聯繫與輿情資料蒐集及分析。 五、印信典守、文書收發、繕校、公文稽催及檔案管理。 六、員工薪餉清冊之編造與核發及所得稅扣繳。 七、現金出納、票據、有價證券保管及出納帳冊表報處理。 八、駕駛、技工、工友及臨時人員之管理;公務車輛之採購、管理、汰換 、維護、保養及油料購發。 九、財物之購置、保管、各種庶務與財產之異動登記及保管。 十、其他不屬各課、室事項。
第 11 條
人事室掌理事項如下: 一、人事規章與人事管理業務之改進建議及研究發展。 二、組織編制、預算員額、人力規劃、辦事細則及權責劃分。 三、人員考試分發、甄選、任免遷調、動態、銓敘審定及俸給。 四、人員考核、獎懲、考成(績)、服務及差勤管理。 五、人員保障及褒揚。 六、人員出國、訓練、進修及考察。 七、人員退休、資遣、撫卹及保險。 八、人員待遇、福利及文康活動。 九、人事資料登記、保管及表報之編報。 十、其他有關人事事項。
第 12 條
會計室掌理事項如下: 一、歲入、出預(概)算之籌編及分配預算之編報。 二、預算控制及收支憑證之內部審核。 三、各種會計報告、帳簿與備查簿之登錄及編製。 四、採購案件之監標及監驗。 五、工程施工預算、決算及竣工驗收總表之加總。 六、歲出(入)應付(收)款之保留及經費流用。 七、付款憑單、轉帳憑單、收支傳票及轉帳傳票之編製。 八、公務統計資料之蒐集及報送。 九、其他有關會計事項。
第 13 條
政風室掌理事項如下: 一、政風法令之研擬、訂定、修正及宣導。 二、員工貪瀆不法之預防、發掘及處理檢舉。 三、政風興革之建議。 四、政風考核獎懲之建議。 五、公務機密之維護。 六、危害或破壞本機關事件之預防及處理陳情、請願之協助。 七、公職人員財產申報及審查。 八、政風督導小組規劃執行。 九、政風工作年度計畫之策劃、擬訂、預算編列及推動執行。 十、其他有關政風事項。
第 14 條
各工務所任務如下: 一、契約之執行、督導、變更、查證、結算及初驗。 二、營造業承攬土木工程開工、停工、復工、展期及竣工等報核轉報。 三、施工初期動員計畫、工程綜合保險契約等之審查。 四、工程估驗及付款。 五、施工作業及品質管理。 六、工地重大事故現場處理之督促及查報。 七、違約處理建議及改善通知。 八、陳情案件之協調及處理。 九、與其他介面工程介面整合之配合處理。 十、其他有關工務工程事項。