第 2 條
本辦法所稱合作社主管機關：在中央為內政部，在直轄市、縣（市）為直轄市、縣（市）政府；原住民族事務主管機關：在中央為原住民族委員會，在直轄市、縣（市）為直轄市、縣（市）政府；目的事業主管機關指原住民合作社經營業務有關之主管機關。
第 4 條
合作社主管機關輔導籌設原住民合作社作業程序如下：
- 一、調查分析：調查設立主觀、客觀環境因素，並據以分析研判籌設可能性。
- 二、合作教育宣導：對發起人及預定社員等進行合作宣導及教育工作，強化其合作信念。
- 三、輔導籌設：輔導發起人等依程序進行籌設及辦理成立登記等相關工作。
第 6 條
原住民合作社應依合作社法規定召開會議並製作下列報表，報請合作社主管機關查核或備查，並報原住民事務主管機關及目的事業主管機關備查：
- 一、營業收支月報表。
- 二、年度業務報告：包括資產負債表、損益計算表、財產目錄及盈餘分配表。
第 10 條
- 1輔導小組每年得依需要，辦理原住民合作社之稽查；其稽查範圍，以當年度為原則，必要時得由輔導小組定之。
- 2前項稽查內容，包括社務管理、業務經營及財務處理；稽查項目由輔導小組定之。
- 3輔導小組應依稽查結果，提出稽查報告，並對有缺失之原住民合作社，提出具體改進意見，送請其改善。
- 4輔導小組得委託具會計專業知識之個人或團體，會同稽查原住民合作社。