第 4 條
本局設下列科、室及稽徵所：
- 一、綜合規劃科，分二股辦事。
- 二、服務科，分四股辦事。
- 三、稅務資訊科，分六股辦事。
- 四、審查一科，分九股辦事。
- 五、審查二科，分六股辦事。
- 六、審查三科，分四股辦事。
- 七、審查四科，分二股辦事。
- 八、徵收科，分六股辦事。
- 九、法務一科，分二股辦事。
- 十、法務二科，分三股辦事。
- 十一、秘書室，分四股辦事。
- 十二、人事室，分四股辦事。
- 十三、政風室，分二股辦事。
- 十四、主計室，分四股辦事。
- 十五、監察室，分二股辦事。
- 十六、北投稽徵所，分五股辦事。
- 十七、大同稽徵所，分五股辦事。
- 十八、中北稽徵所，分六股辦事。
- 十九、萬華稽徵所，分四股辦事。
- 二十、南港稽徵所，分四股辦事。
- 二十一、文山稽徵所，分四股辦事。
- 二十二、中南稽徵所，分七股辦事。
- 二十三、士林稽徵所，分五股辦事。
- 二十四、內湖稽徵所，分六股辦事。
第 5 條
綜合規劃科掌理事項如下：
- 一、本局業務方針、施政計畫及作業手冊之彙編。
- 二、研究發展工作之規劃、研析、推動及管考。
- 三、重要業務之協調及聯繫。
- 四、稽徵業務考核及公文檢核作業。
- 五、各稅審查案件之複核。
- 六、其他有關綜合規劃事項。
第 6 條
服務科掌理事項如下：
- 一、納稅服務業務之規劃、執行、督導及管制。
- 二、國稅稅政法令宣導之規劃、執行、督導及管制。
- 三、媒體公關事務之政策規劃、研擬、執行及管考。
- 四、華僑及外國人所得稅稽徵業務之規劃、收件、查核、徵收。
- 五、其他有關服務管理事項。
第 7 條
稅務資訊科掌理事項如下：
- 一、稅務應用系統維運及支援系統整體規劃。
- 二、本局與所屬機關資訊應用服務策略之規劃及協調推動。
- 三、稅務及行政資訊服務平台之維運管理。
- 四、本局與所屬機關資訊應用環境之規劃及管理。
- 五、本局與所屬機關資訊資通安全之規劃及推動。
- 六、各項課稅資料之蒐集、登錄、整理、通報運用及保管。
- 七、其他有關稅務資訊事項。
第 9 條
審查二科掌理事項如下：
- 一、綜合所得稅稽徵作業之規劃及督導。
- 二、扣繳、非扣繳作業之規劃及督導。
- 三、執行業務者、補習班、幼稚園、托兒所案件之規劃、查核、督導及管制。
- 四、個案調查案件之規劃、查核及管制。
- 五、遺產及贈與稅稽徵作業之規劃、督導及案件之查核、管制。
- 六、綜合所得稅、遺產及贈與稅相關稅務法令之請釋及解答。
- 七、其他有關綜合所得稅、遺產及贈與稅事項。
第 10 條
審查三科掌理事項如下：
- 一、證券交易稅、期貨交易稅、貨物稅、菸酒稅、特種貨物及勞務稅稽徵作業之規劃、執行及管制。
- 二、檢舉、違章案件之規劃、查核及督導。
- 三、虛報薪資案件之查核。
- 四、證券交易稅、期貨交易稅、貨物稅、菸酒稅、特種貨物及勞務稅相關稅務法令疑義之請釋及解答。
- 五、其他有關檢舉業務、證券交易稅、期貨交易稅、貨物稅、菸酒稅、特種貨物及勞務稅事項。
第 11 條
審查四科掌理事項如下：
- 一、營業稅稽徵作業之規劃、督導及管制。
- 二、營業稅案件之查核。
- 三、虛設行號案件之查核及督導。
- 四、記帳及報稅代理業務人、記帳士執業登錄作業與記帳及報稅代理業務人專業訓練機構之管理。
- 五、營業稅相關稅務法令疑義之請釋及解答。
- 六、其他有關營業稅事項。
第 12 條
徵收科掌理事項如下：
- 一、國稅稅款徵收、劃解、退稅業務之規劃、執行、督導及管制。
- 二、國稅欠稅清理、稅捐保全、欠稅移送執行等業務之規劃、執行、督導及管制。
- 三、遺產及贈與稅實物抵繳案件、擔保案件之處理。
- 四、其他有關徵收事項。
第 13 條
法務一科掌理事項如下：
- 一、營利事業所得稅、營業稅行政救濟案件之審理及管制。
- 二、營利事業所得稅、營業稅違章案件之審理、裁罰及管制。
- 三、違反記帳士法第三十四條案件之審理、處罰及行政救濟之擬議。
- 四、稅務法令之整理、彙編及適用疑義之研議。
- 五、刑事訴訟案件之處理（不含虛設行號案件）。
- 六、國家賠償案件之處理。
- 七、其他有關營利事業所得稅、營業稅之法務事項。
第 14 條
法務二科掌理事項如下：
- 一、綜合所得稅、遺產及贈與稅、貨物稅、菸酒稅、證券交易稅、期貨交易稅、特種貨物及勞務稅行政救濟案件之審理及督導。
- 二、綜合所得稅、遺產及贈與稅、貨物稅、菸酒稅、證券交易稅、期貨交易稅、特種貨物及勞務稅違章案件之審理及裁罰。
- 三、檢舉人獎金之核發。
- 四、其他有關綜合所得稅、遺產及贈與稅、貨物稅、菸酒稅、證券交易稅、期貨交易稅、特種貨物及勞務稅之法務事項。