第 2 條
本基金為預算法第四條第一項第二款所定之特種基金，編製附屬單位預算 ，下設醫療發展基金、全民健康保險紓困基金、藥害救濟基金、菸害防制 及衛生保健基金、預防接種受害救濟基金、疫苗基金及食品安全保護基金 七個基金，編製附屬單位預算之分預算。
第 3 條
本基金之管理機關為衛生福利部（以下簡稱本部），下設各基金之管理機 關，除醫療發展基金同為本部外，其餘如下： 一、全民健康保險紓困基金：本部中央健康保險署。 二、藥害救濟基金、食品安全保護基金：本部食品藥物管理署。 三、菸害防制及衛生保健基金：本部國民健康署。 四、預防接種受害救濟基金、疫苗基金：本部疾病管制署。
第 4 條
本基金之來源如下：
一、政府循預算程序之撥款。
二、醫療發展基金收入。
三、全民健康保險紓困基金收入。
四、藥害救濟基金收入。
五、菸害防制及衛生保健基金收入。
六、預防接種受害救濟基金收入。
七、疫苗基金收入。
八、食品安全保護基金收入。
九、其他有關收入。
前項第三款所定全民健康保險紓困基金之來源如下：
一、政府循預算程序之撥款。
二、捐贈收入。
三、全民健康保險紓困基金之孳息收入。
四、公益彩券回饋金收入。
五、菸品健康福利捐分配之收入。
第一項第四款所定藥害救濟基金之來源如下：
一、藥物製造業者及輸入業者繳納之徵收金。
二、滯納金。
三、代位求償之所得。
四、捐贈收入。
五、藥害救濟基金之孳息收入。
六、其他有關收入。
第一項第六款所定預防接種受害救濟基金之來源如下：
一、疫苗製造或輸入廠商依傳染病防治法規定繳納之徵收金收入。
二、捐贈收入。
三、預防接種受害救濟基金之孳息收入。
第一項第七款所定疫苗基金之來源如下：
一、政府循預算程序之撥款。
二、公益彩券盈餘、菸品健康福利捐。
三、捐贈收入。
四、疫苗基金之孳息收入。
五、其他有關收入。
第一項第八款所定食品安全保護基金之來源如下：
一、政府循預算程序之撥款。
二、違反食品安全衛生管理法罰鍰之部分提撥。
三、依食品安全衛生管理法科處並繳納之罰金、沒收、追徵或抵償之現金
或變賣所得。
四、依食品安全衛生管理法或行政罰法規定沒入、追繳、追徵或抵償之不
當利得部分提撥。
五、食品安全保護基金之孳息收入。
六、捐贈收入。
七、其他有關收入。第 5 條
本基金之用途如下：
一、醫療發展基金支出。
二、全民健康保險紓困基金支出。
三、藥害救濟基金支出。
四、菸害防制及衛生保健基金支出。
五、預防接種受害救濟基金支出。
六、疫苗基金支出。
七、食品安全保護基金支出。
八、管理及總務支出。
九、其他有關支出。
前項第二款所定全民健康保險紓困基金之用途如下：
一、提供經濟困難無力繳納保險費之保險對象無息申貸下列費用：
（一）依全民健康保險法第二十七條規定之自付保險費。
（二）依全民健康保險法第四十三條及第四十七條規定應自行負擔之費用
。
二、協助弱勢族群排除就醫障礙支出。
三、補助中低收入戶參加全民健康保險應自付之保險費。
前條第二項第四款之收入，應專供前項第二款用途之用；前條第二項第五
款之收入，應專供前項第三款用途之用。
第一項第三款所定藥害救濟基金之用途如下：
一、藥害救濟金之給付。
二、委託或補助其他機關（構）或團體辦理藥害救濟有關事項之支出。
三、委託或補助藥害及藥物副作用防制事項之支出。
四、減少藥害及藥物副作用之獎勵、研究及策略研訂事項之支出。
五、涉及藥害及藥物副作用之國際合作相關事項之支出。
六、執行藥害救濟調查及審議相關費用事項之支出。
第一項第五款所定預防接種受害救濟基金之用途如下：
一、預防接種受害救濟之給付。
二、辦理預防接種副作用之防治及通報支出。
三、辦理減少預防接種副作用之獎勵、研究及策略研訂支出。
四、辦理預防接種受害救濟及預防接種副作用之國際合作支出。
五、辦理預防接種受害救濟之受理、調查及審議支出。
六、委託或補助辦理預防接種受害救濟相關支出。
第一項第六款所定疫苗基金之用途如下：
一、疫苗採購支出。
二、辦理預防接種各項業務與相關設備購置、維護及管理等支出。
三、辦理預防接種相關之研究調查、訓練及國際合作等支出。
四、委託、補助及獎勵辦理預防接種等支出。
第一項第七款所定食品安全保護基金之用途如下：
一、補助消費者保護團體因食品衛生安全事件依消費者保護法之規定，提
起消費訴訟之律師報酬及訴訟相關費用。
二、補助經公告之特定食品衛生安全事件，有關人體健康風險評估費用。
三、補助勞工因檢舉雇主違反食品安全衛生管理法之行為，遭雇主解僱、
調職或其他不利處分所提之回復原狀、給付工資及損害賠償訴訟之律
師報酬及訴訟相關費用。
四、補助依食品安全衛生管理法第四十三條第二項所定辦法之獎金。
五、補助其他有關促進食品安全之相關費用。