命令
- C 型肝炎病毒核酸對照標準品供應收費標準
- 乳品類衛生標準（93.08.17訂定）
- 乳品食品工廠產品衛生檢驗辦法
- 二溴乙烷殘留容許量標準
- 健康照護基金收支保管及運用辦法
- 健康食品查驗登記審查費收費標準
- 優良藥品製造標準
- 冰類微生物衛生標準
- 冷凍食品類微生物衛生標準
- 包裝飲用水及盛裝飲用水微生物衛生標準
- 嬰兒食品類微生物衛生標準
- 市售包裝維生素礦物質類之錠狀膠囊狀食品營養標示方式及內容標準
- 水產動物類衛生標準
- 活體肝臟捐贈移植許可辦法
- 液蛋衛生標準
- 牛羊豬及家禽可食性內臟重金屬限量標準
- 生熟食混合即食食品類衛生標準
- 生食用食品類衛生標準（96.12.21訂定）
- 生鮮肉品類衛生標準
- 社會福利基金收支保管及運用辦法
- 罐頭食品類微生物衛生標準
- 莫拉克颱風受災農民健康保險及國民年金保險被保險人保險費補助辦法
- 蔬果植物類重金屬限量標準
- 藥師執業登記及繼續教育辦法
- 藥物優良製造證明書申請辦法
- 藻類食品衛生標準
- 蛋類衛生標準
- 行政院衛生署受理食品、食品添加物查驗、登記審查費收費標準
- 行政院衛生署宜蘭醫院辦事細則
- 行政院衛生署專業獎章頒給辦法
- 行政院衛生署新竹醫院辦事細則
- 行政院衛生署竹東醫院辦事細則
- 行政院衛生署管制藥品管理局製藥工廠設置辦法
- 行政院衛生署辦理兒童及少年性交易防制教育宣導辦法
- 衛生福利部受理食品及食品添加物查驗登記審查費證書費收費標準
- 西藥及醫療器材查驗登記審查費收費標準
- 醫院附設殮殯奠祭設施管理辦法
- 醬油類單氯丙二醇衛生標準（98.01.15訂定）
- 鑲牙生管理規則
- 食品中多氯聯苯限量標準
- 食品中真菌毒素限量標準
- 食品業者衛生安全管理驗證及委託驗證管理辦法
- 食品用一氧化二氮衛生標準
- 食品衛生查驗業務驗證機構認證及管理辦法
- 食用油脂類衛生標準
- 食用菇類重金屬限量標準
- 食用藻類衛生標準
- 食米重金屬限量標準（93.03.05訂定）
- 食鹽衛生標準（95.01.16訂定）
- 飲料類微生物衛生標準