命令
- 偶蹄類動物進出澎湖地區檢查規則
- 動植物檢疫規費收費實施辦法
- 動物傳染病防治條例施行細則
- 動物傳染病防治條例補償評價委員會之組成人員及評價標準
- 動物及其產品進出金門馬祖地區檢查規則
- 動物感染性生物材料管理辦法
- 動物收容處所設置組織準則
- 動物用生物藥品查驗辦法
- 動物用藥品使用準則
- 動物用藥品優良製造準則
- 動物用藥品委託製造管理辦法
- 動物用藥品新藥試驗辦法
- 動物用藥品樣品試製及田間試驗管理辦法
- 動物用藥品檢驗標準
- 動物用藥品檢驗登記審查準則
- 動物用藥品管理法施行細則
- 動物用藥品製造廠設廠標準
- 動物用藥品製造業者輸入自用原料管理辦法
- 動物用藥品許可查驗規費收費標準
- 動物用藥品販賣業管理辦法
- 化製場及化製原料運輸車消毒及查核辦法
- 密閉式貨櫃運送動物產品輸入檢疫作業辦法
- 屠宰作業準則
- 屠宰場設置標準
- 屠宰用牛隻輸入檢疫作業辦法
- 屠宰衛生檢查收費標準
- 屠宰衛生檢查規則（89.04.19訂定）
- 指定動物傳染病檢驗及檢驗機構管理辦法
- 旅客及服務於車船航空器人員攜帶動植物檢疫物檢疫作業辦法
- 檢舉動物用偽藥禁藥及劣藥獎勵辦法
- 檢舉走私進口動植物及其產品獎勵辦法
- 檢舉違反動物保護法案件獎勵辦法
- 清除豬瘟暨口蹄疫所需疫苗之種類及其管理辦法
- 獸醫師執業登記及繼續教育辦法
- 獸醫師法施行細則
- 獸醫師（佐）處方藥品販賣及使用管理辦法
- 輸入動物用藥品樣品贈品管理辦法
- 輸入應施檢疫物追蹤檢疫執行辦法
- 鳥類輸出產地檢疫作業辦法