命令
- 乳業管理規則
- 二十噸以上漁船安裝主機之最大馬力限制標準
- 促進農業企業機構研發輔導辦法
- 保護牲畜辦法
- 優良農產品證明標章認證及驗證作業辦法
- 動物用抗生素麻醉毒劇及生物藥品管理辦法
- 大西洋大目鮪組延繩釣漁船搭載觀察員辦法
- 大陸地區農業專業人士來臺從事農業相關活動許可辦法
- 大養豬場管理辦法
- 對外漁業合作辦法
- 屠宰牲畜管理辦法
- 屠宰衛生檢查規則（65.07.27訂定）
- 山坡地開發基金收支保管及運用辦法
- 新興重要策略性產業屬於農業部分獎勵辦法
- 有機農產品及有機農產加工品驗證管理辦法
- 林務發展基金收支保管及運用辦法
- 植物或植物產品運出金門馬祖地區檢查辦法
- 植物新品種登記及種苗業登記應繳費用種類及收費標準
- 沒收之偽農藥器械原料暨沒入之劣農藥物品處理辦法
- 清除新城雞病使用疫苗之種類及其管理辦法
- 漁產平準基金收支保管及運用辦法
- 漁船及船員在國外基地作業管理辦法
- 牧場登記規則
- 犬貓輸入檢疫作業辦法
- 糧商登記規則
- 糧食倉儲及運輸損耗率計算規則
- 糧食倉庫管理辦法
- 糧食平準基金收支保管及運用辦法
- 肥料管理規則
- 臺灣區食用菇類菌種場設置及輔導辦法
- 臺灣地區學術性農林作物種子與種苗輸出管理辦法
- 臺灣地區漁船海難救護互助辦法（74.07.27訂定）
- 臺灣地區漁船船主接駁受僱大陸地區船員許可辦法
- 臺灣地區蠶絲業管理辦法
- 臺灣地區進出口糧食及攜帶航程糧食管理辦法
- 臺灣省農田水利會會務委員會議事規則（新 89.06.14 訂定）
- 蠶種冷藏取締辦法
- 蠶種製造條例施行細則
- 行政院農業委員會動物保護委員會設置辦法
- 行政院農業委員會各區糧食管理處暫行組織規程
- 行政院農業委員會各區農業改良場暫行組織規程
- 行政院農業委員會實驗動物倫理委員會設置辦法
- 行政院農業委員會水土保持局各工程所暫行組織規程
- 行政院農業委員會水土保持局暫行組織規程
- 行政院農業委員會漁業幹部船員訓練中心組織規程
- 行政院農業委員會漁業署臺灣區漁業廣播電臺暫行組織規程
- 行政院農業委員會種苗改良繁殖場暫行組織規程
- 行政院農業委員會茶業改良場暫行組織規程
- 行政院農業委員會農業藥物毒物試驗所技術服務收費標準（102.11.12訂定）
- 走私進口農產品處理辦法
- 輔導農業生物技術研發成果產業化辦法
- 農業天然災害嚴重程度認定標準
- 農業平準基金收支保管及運用辦法
- 農業推廣實施辦法
- 農業推廣規程
- 農業生物技術研發成果產業化輔導辦法
- 農業產業技術研究發展補助辦法
- 農業產銷班組織輔導辦法
- 農業財團法人監督準則
- 農業購置設備或技術適用投資抵減辦法
- 農業金融機構對達一定金額以上通貨交易及疑似洗錢交易申報辦法
- 農民健康保險爭議事項審議辦法
- 農民健康保險監理委員會組織規程
- 農田水利會會務委員遴派辦法
- 農田水利會會長遴派辦法
- 農田水利會聯合會組織規程
- 農藥委託田間試驗收費標準
- 農藥檢驗收費標準
- 造林基金收支保管及運用辦法
- 進口原料糯（碎）米加工外銷管理辦法
- 進口有機農產品及有機農產加工品管理辦法
- 運用糧食平準基金收購稻米實施辦法
- 陸上魚塭養殖漁業登記及管理規則
- 電動屠宰場設置標準